高通量測序，也叫“下一代測序”，最新的是三代測序，是一種快速測定大量DNA序列的技術(shù)，主要應用于DNA測序、RNA測序、表觀(guān)遺傳學(xué)等基因組測序及轉錄測序等，它有力地推動(dòng)生物科學(xué)研究的發(fā)展，也與人類(lèi)的生活與健康息息相關(guān)，在微生物與人體健康系統的生態(tài)平衡、新生兒疾病篩查、腫瘤的診斷與治療、遺傳病和耐藥性檢測等領(lǐng)域都有廣泛的臨床應用。
近日，寶德為世紀壇醫院升級打造的高性能計算集群系統，提供了堅實(shí)可靠的計算和存儲底座，助力醫院高通量測序更加快速精準，為加速醫院臨床科研和成果轉化奠定良好的基礎。
首都醫科大學(xué)附屬北京世紀壇醫院（文中簡(jiǎn)稱(chēng)“世紀壇醫院”）是集醫療、教學(xué)、科研、預防和保健為一體的三級甲等綜合醫院，擁有高水平的醫療專(zhuān)家人才隊伍，先進(jìn)的醫療技術(shù)和設備、以及非常優(yōu)秀的醫療水平，多次承擔國際醫療援助、精準扶貧與國內對口援助、大型醫療保障任務(wù)。同時(shí)，醫院堅持科研教學(xué)齊頭并進(jìn)，不斷加強在醫學(xué)創(chuàng )新和科研項目的投入，并且加強國際合作，全力打造示范新型的現代臨床研究體系。世紀壇醫院原有IT系統的服務(wù)對象非常廣泛，既是各實(shí)驗室、各學(xué)科方向的科研支撐平臺，也是基因測序的核心計算和數據匯聚平臺，所以用戶(hù)數量很大而且離散度高、應用軟件種類(lèi)多而雜。隨著(zhù)科研業(yè)務(wù)發(fā)展和數據量的暴增，原系統在應對計算密集、網(wǎng)絡(luò )密集、IO密集、耦合密集型等不同硬件需求，以及高并發(fā)、快速實(shí)時(shí)響應等要求面前開(kāi)始顯得無(wú)力，強穩定性、高擴展性和高度自動(dòng)化運維的新型高性能計算集群呼之欲出。基于客戶(hù)實(shí)際需求的深入調研，考慮到新系統主要是為承擔實(shí)驗后期的高通量測序任務(wù)，同時(shí)要存儲測序后產(chǎn)生的日益增多的基因組數據，寶德為世紀壇醫院升級打造了高性能集群系統，該系統集合寶德高密度四子星計算服務(wù)器PR2720TW、寶德大內存計算服務(wù)器PR4865P、寶德分布式并行存儲PLStor、圖形工作站PT6630W、寶德交換機及寶德集群管理軟件于一體，整體可提供416個(gè)CPU計算核心、內存總量6.75TB、Tflops 峰值達29.08萬(wàn)億次、并行存儲裸容量1050TB的計算和存儲算力；同時(shí)，系統采用100GB IB網(wǎng)絡(luò )，可以有效保障大模型大數據集的需求，并利用現有采用管理網(wǎng)絡(luò )，連接所有節點(diǎn)。此外，新系統配置的寶德集群管理套件，能提供集群的管理、監控、資源調度等使用接口和管理接口界面，非常方便客戶(hù)的日常運維，幫助客戶(hù)高效利用集群計算和存儲資源，并且有效降低成本。客戶(hù)表示，寶德高性能計算集群的硬件系統包含了登錄/管理節點(diǎn)、高密度計算節點(diǎn)、大內存節點(diǎn)、分布式并行存儲、千兆管理網(wǎng)絡(luò )、萬(wàn)兆網(wǎng)絡(luò )等硬件設備，軟件系統包含了集群基礎環(huán)境軟件、集群系統管理軟件、分布式并行存儲系統軟件、生信分析軟件及流程中間件軟件等，二者合力能為醫院的高通量測序保駕護航。而且，在硬件系統上架安裝、布線(xiàn)、加電、確保與現有設備的有效連接，軟件集成的安裝和實(shí)施，應用系統的集成和系統優(yōu)化、測試和多維度的項目培訓……在整個(gè)項目的交付和實(shí)施、測試過(guò)程中，寶德團隊表現了高度專(zhuān)業(yè)性和責任心，既滿(mǎn)足了醫院科研支撐平臺先進(jìn)高效、穩定可靠的算力要求，又給科研工作和日常運維帶來(lái)了超出預期的增值服務(wù)體驗。科技的終極目標是服務(wù)于人類(lèi)，高通量測序技術(shù)關(guān)系到人類(lèi)基因和生命密碼。國家發(fā)改委《“十四五”生物經(jīng)濟發(fā)展規劃》提出，要加快發(fā)展高通量基因測序技術(shù)，推動(dòng)以單分子測序為標志的新一代測序技術(shù)創(chuàng )新，不斷提高基因測序效率、降低測序成本。寶德將繼續發(fā)揮自身在信息科技領(lǐng)域的技術(shù)優(yōu)勢，攜手廣大合作伙伴，以更加先進(jìn)的軟硬件產(chǎn)品方案和全棧服務(wù)為包括世紀壇醫院等在內的更廣泛醫療衛生行業(yè)客戶(hù)提供堅實(shí)的算力底座，助力中國醫療科技和醫學(xué)科研行穩致遠！
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