RM新时代实业有限公司
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    解決方案

    以客戶(hù)為中心,提供定制化或一站式的全棧解決方案,賦能千行百業(yè)

    寶德高性能計算之生命科學(xué)解決方案
    項目背景

    多場(chǎng)景應用多需求:生物信息學(xué)(序列搜尋比對分析)--需要較大的內存容量和內存帶寬, 需要直連架構CPU;分子動(dòng)力學(xué)--對網(wǎng)絡(luò )需求比較大,節點(diǎn)間需要使用低延時(shí),高帶寬的Infiniband高速網(wǎng);分子對接(藥物設計)--計算量非常大,消耗計算機時(shí)很多;測序儀離線(xiàn)處理--內存、存儲容量需求大,作業(yè)運行需要與作業(yè)調度系統結合;電子顯微鏡圖象處理--軟件內存需求和IO需求較大,計算時(shí)間長(cháng),系統穩定性、可靠性要求高;質(zhì)譜儀原始資料處理--系統計算量大,計算時(shí)間長(cháng),系統穩定性,可靠性要求高。

    方案介紹

    基于寶德PowerScale 8000高性能計算集群是一個(gè)有機的、高性能、高可靠性的集群系統。系統的硬件都選用經(jīng)過(guò)嚴格測試的主流產(chǎn)品,保證系統的可靠性;互聯(lián)系統各組件的網(wǎng)絡(luò )都是專(zhuān)用的高效網(wǎng),通過(guò)集群核心的管理系統使得整個(gè)系統協(xié)調一致的運行,如單獨的一臺高性能計算機一樣為用戶(hù)提供統一的服務(wù)。PowerScale 8000向用戶(hù)提供一個(gè)單一計算機的界面。前置計算機負責與用戶(hù)交互,并在接受用戶(hù)提交的計算任務(wù)后通過(guò)調度器程序將任務(wù)分配給各個(gè)計算節點(diǎn)執行;運行結束后通過(guò)前置計算機將結果返回給用戶(hù)。程序運行過(guò)程中的進(jìn)程間通信通過(guò)專(zhuān)用網(wǎng)絡(luò )進(jìn)行。

    方案解析

    PowerScale 8000系統共配置10 個(gè)雙路八核刀片服務(wù)器。刀片式集群系統在計算密度、功耗散熱、運營(yíng)成本、維護成本、可靠性等方面,都明顯優(yōu)于其它系統,且為系統的擴容升級提供了良好的基礎。計算系統的選擇實(shí)現了多樣化,分別配置了最通用的雙路八核的刀片節點(diǎn),這樣的配置可以更好滿(mǎn)足不同應用的需求。配置高性能的光纖 SAN 存儲系統,配置 20TB 磁盤(pán)陣列存儲,配置并行文件系統,實(shí)現了多分區的統一管理和多通道的并發(fā)讀寫(xiě)。管理網(wǎng)絡(luò )采用千兆網(wǎng)絡(luò ),計算網(wǎng)絡(luò )采用Infiniband高速網(wǎng)絡(luò )互連;主要產(chǎn)品都采用了冗余設計(電源、風(fēng)扇等),存儲系統采用雙鏈路冗余設計,系統的可靠性有較高保證;對于與測序儀鏈接的服務(wù)器和存儲設備,配置了雙機熱備,保證了系統的可靠性。寶德公司將為用戶(hù)提供完善的服務(wù),包括安裝調試、系統優(yōu)化、用戶(hù)培訓等,這些都不單獨收費,用戶(hù)不必考慮這些方面的費用。

    方案優(yōu)勢
    • 系統

      系統協(xié)調高效

    • 高性?xún)r(jià)比

      高性?xún)r(jià)比且方便后期擴容升級

    • 高可靠性

      高可靠性和完善的服務(wù)

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